5月7日，“海洋六號”駛入了今年第七號臺風“海豚”的“勢力范圍”，海況越來越差，涌浪接近3米。

負責多波束作業的調查部部門長于宗澤說，“海況變差以后，多波束作業收到的數據量越來越少，甚至出現了數據丟失的情況。”據他介紹，由于涌浪拍打船體產生大量氣泡，多波束系統的換能器在發送或接收波束時被氣泡阻擋，造成了部分數據丟失。盡管“海洋六號”按作業要求降低到了7節的航速，但直到5月9日上午8時，多波束系統采集的數據仍不理想。

面對嚴峻的天氣，船長藍明華在臨時黨委會上及時做了通報，并建議調整航向，往緯度更高的工作區航行，降低臺風對船舶航行的影響。首席科學家劉方蘭根據目前的天氣情況，向中國大洋協會和廣州海洋地質調查局請示后，決定暫時放棄原計劃的兩個工作區，轉向500公里外的另一個備用工作區邊避風邊開展調查。

據藍明華介紹，2014年西太平洋海域臺風數量明顯偏少，據統計只有21個，低于26個的年平均水平，但今年的臺風來勢有點“兇猛”，需要提前做好應變措施。“要說避風，太平洋和近海有很大的不同，在沿海作業時，可以選擇臺風移動路徑以外的錨地避風，在離最近陸地海島超過1000公里的太平洋上作業，在水深幾千米的海域是不可能拋錨避風的，只能根據臺風移動的相反方向，到臺風大風半徑外滯航。”藍明華說。

據悉，為了確保安全，“海洋六號”已經啟動應急預案：一是每天增加收集氣象資料頻率，實時關注氣象動態；二是及時對輪機設備進行檢修，保障避風時的動力支持；三是檢查各部門設備固定情況，特別是后甲板調查設備固定情況；四是選擇影響相對較小的區域作業，根據臺風動態提前中止作業到安全海域避風。

目前，“海洋六號”已經離開臺風影響區域，各項調查作業也已陸續恢復。